都市によって留学費用はかわりますか?

場合によります。

滞在先や食費、日用品は都市よりも田舎の方が安い傾向にあります。しかし都市でも工夫すれば節約することは可能です。
また費用面は留学プランに大きく左右されるので、一概には言えません。